Proteiny spojené se sbalováním komplexu telomerázy

Kristína Mlynárová

Bachelor's thesis

Telomerase assembly associated proteins

Abstract:

The physical ends of linear chromosomes protecting the internal regions of the chromosomes are called telomeres. Due to limited ability of the enzymes of the replication machinery to synthesize the ends of chromosomal DNA during repeated cell division, telomeres shorten with each cell cycle. In most cell types the enzyme telomerase is involved in maintaining their length. Telomerase is a reverse transcriptase consisting of the protein subunit TERT and the RNA subunit TR. A large number of proteins, such as TR- or TERT-associated proteins, telomere-binding proteins, nucleolar proteins or various chaperones are involved in the assembly, regulation and localization of telomerase. This bachelor thesis addresses a group of proteins from the model plant Arabidopsis thaliana, which are thought to be involved in the assembly of the plant telomerase complex. There are five main protein candidates: CBF5, NHP2, NOP10, NAF1 and GAR1. The mammalian homologues of these proteins interact with the TR subunit of the enzyme, assist on telomerase assembly and thus ensure its functionality and stability. The aim of this work is to prepare recombinant sequences of chosen genes encoding plant homologues of these proteins and subsequently to clone these sequences into suitable destination vectors that may be used for the study of protein-protein interactions.

Abstract:

Fyzické konce lineárnych chromozómov tvoria špecializované štruktúry, ktoré sa nazývajú teloméry. V dôsledku neschopnosti enzýmov replikačného aparátu dosyntetizovať konce chromozomálnej DNA počas opakujúceho sa bunkového delenia sa však teloméry s každým bunkovým cyklom skracujú. Vo väčšine buniek sa na udržiavaní ich dĺžky podieľa enzým telomeráza. Telomeráza je reverzná transkriptáza skladajúca sa z proteínovej podjednotky TERT a RNA podjednotky TR. Na skladaní, regulácii a lokalizácii telomerázy sa však naviac podieľa značné množstvo proteínov ako sú napríklad rôzne TR- či TERT-asociované proteíny, telomér-väzobné proteíny, jadierkové proteíny alebo chaperony. Táto bakalárska práca sa zaoberá skupinou proteínov rastliny Arabidopsis thaliana, u ktorých sa predpokladá, že by sa mohli podieľať na zbaľovaní rastlinného telomerázového komplexu. Konkrétne ide o skupinu piatich proteínov: CBF5, NHP2, NOP10, NAF1 a GAR1. Predpoklad funkcie uvedenej skupiny proteínov vychádza zo zistenia, že u živočíchov tieto proteíny interagujú s TR podjednotkou enzýmu telomerázy, podieľajú sa na jej zbaľovaní a zabezpečujú tak jej funkčnosť a stabilitu. Cieľom tejto práce bolo preto pripraviť rekombinantné sekvencie génov kódujúcich rastlinné homológy vybraných proteínov a následne tieto sekvencie naklonovať do príslušných destinačných vektorov, ktoré sú vhodné pre expresiu v systémoch využívaných pre štúdium proteín-proteínových interakcií.

Kľúčové slová

Arabidopsis thaliana, klonovanie, telomeráza, teloméry, telomeráza-asociované proteíny, cloning, telomerase, telomeres, telomerase-associated proteins

Jazyk práce: Slovak

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 17. 6. 2020

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 16. 7. 2020
• Vedúci: Mgr. Petra Procházková Schrumpfová, Ph.D.
• Oponent: Mgr. Lucie Bozděchová, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Biochemistry / Biochemistry