Využití metagenomických postupů pro detekci patogenů v klinické praxi – Bc. Annamária Macháčková
Bc. Annamária Macháčková
Master's thesis
Využití metagenomických postupů pro detekci patogenů v klinické praxi
The use of metagenomic approaches for the detection of pathogens in clinical practice
Abstract:
Detekce patogenů v rutinní diagnostice představuje komplexní proces, zahrnující metody kultivační či serologické, anebo metody molekulární (specifická PCR, univerzální PCR, Sangerovo sekvenování). Narůstající výskyt vzácných oportunních patogenů ztěžuje detekci již zavedenými postupy, které jsou přizpůsobené identifikaci typických patogenů. Běžně se používají metody specifické, kde je důležité tyto …moreAbstract:
Pathogen detection in routine diagnostics can be a complex process incorporating culture, serology or molecular methods (specific PCR, universal PCR, Sanger sequencing). Increasing incidence of rare opportunistic pathogens complicates detection with conventional laboratory techniques, which are adjusted for known and typical pathogen identification. It is common to use targeted methods, where it is …more
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 12. 5. 2023
Identifier:
https://is.muni.cz/th/upyv6/
Thesis defence
- Date of defence: 21. 6. 2023
- Supervisor: prof. MUDr. Tomáš Freiberger, Ph.D.
- Reader: Mgr. Lenka Kosečková Micenková, Ph.D.
Citation record
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceMaster programme / field:
Microbiology / Microbiology
Theses on a related topic
-
Optimizing soil nucleic acid extraction protocol to fit third-generation, single-strand sequencing technologies
Dmytro SHUMLIANSKYI -
Analýza patogenních genetických variant u dětí s mentálními retardacemi pomocí metod komparativní genomové hybridizace na mikročipech (array-CGH) a sekvenování "nové generace" (NGS)
Markéta Wayhelová -
Analýza vybraných genů pro stanovení genetických predispozic ovlivňujících sportovní výkon pomocí sekvenování nové generace
Lucie Kulišťáková -
Molekulární charakterizace rezistence a virulence epidemických klonů Klebsiella pneumoniae pomocí sekvenování nové generace
Martina Strnadová -
Isocitrát dehydrogenáza u difúzních gliomů: mutační analýza genů IDH1/2 pomocí sekvenování nové generace (NGS)
Kateřina Zettlová -
Aplikace sekvenování nové generace pro fylogenetickou analýzu bakteriálních genomů a metagenomiku
Vojtěch Kovařovic -
Sekvenování nové generace při studiu regulace genů u rostlin
David Vlk -
Detekce patogenních genetických variant pomocí sekvenování nové generace u dětských pacientů s mentální retardací
Hana Poláčková