Vývoj a testování nových způsobů elektrochemického značení DNA a jejich využití v hybridizační analýze

Bc. Jan Špaček

Diplomová práce

Development and testing of novel techniques of electrochemical DNA labeling and their utilization the hybridization analysis

Anotace:

V této práci jsem testoval v nově syntetizované elektrochemické značky s alkylthiolovou skupinou, jejich enzymatickou inkorporaci do řetězce DNA a jejich elektrochemické vlastnosti. Dále jsem zjistil, že je možné využít nitro- skupinu ke značení bází DNA, tyto báze enzymaticky inkorporovat do DNA a pomocí elektrochemických metod provést jejich detekci. Takto připravená DNA je možná využít pro detekci hybridizace syntetických oligonukleotidů, případně k hybridizaci celogenomové DNA, prostřednictvím metody, kterou jsem za tímto účelem vyvinul.

Abstract:

In this diploma work I tested newly synthesized alkylthiol- labels, designed for DNA labeling and electrochemical detection. I succeeded in enzymatic incorporation of these labels and found some interesting interfacial properties of those labels. I also presented DNA labels with nitro- group, their electrochemical properties and their ability to be enzymticaly incorporated to DNA. I concluded that those labels can be used for hybridization detection of synthetic oligonucleotides and developed a new method for whole genome hybridization, which utilize enzymatical incorporation of such labels.

Klíčová slova

DNA, DNA labels, electrochemistry of DNA, Terminal deoxynucleotidyl transferase, DNA hybridization DNA, DNA značky, elektrochemie DNA, terminální transferáza, hybridizace DNA

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 16. 5. 2011

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 9. 6. 2011
• Vedoucí: Mgr. Luděk Havran, Dr.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Molekulární biologie a genetika