Detekce vybraných miRNA u pacientek s ,,triple-negativním" karcinomem prsu

Mgr. Aneta BRISUDOVÁ

Master's thesis

Detection of selected miRNAs in patiens with "triple-negative" breast cancer.

Abstract:

Nádorová onemocnění přestavují celosvětový problém. Vzhledem k jejich neustále se zvyšující incidenci je velké množství výzkumů zaměřeno na vývoj diagnostických, prognostických a prediktivních znaků se snahou o zlepšení a usnadnění diagnostiky a následné léčby. Tato práce je zaměřena na studium karcinomu prsu, který představuje nejčastěji diagnostikovaný typ nádorového onemocnění u žen. Konkrétně se zabývá ,,triple-negativním" karcinomem prsu (TNBC), který je charakteristický nízkou expresí estrogenových a progesteronových receptorů a receptorů pro lidský epidermální růstový faktor 2. Velké omezení diagnostiky TNBC přestavuje nedostatečné množství biologických markerů. Cílem této práce je detekce vybraných miRNA, které se liší profilem genové exprese v různých morfologických entitách přítomných v nádoru. Tato nádorová heterogenita odráží jak odlišné chování jednotlivých buněčných typů, tak i odezvu na terapii. Na základě výsledků získaných z analýzy jednotlivých morfologických struktur pomocí mikročipové analýzy bylo vybráno 8 miRNA (miR-200C-3p, miR-205-5p, miR-150-5p, miR-185-5p, miR-155-5p, miR-4417, miR143-3p, miR-182-5p), jejichž heterogenní exprese byla následně ověřena metodami ISH a RT-qPCR. Různé hladiny exprese vybraných miRNA jsou pravděpodobně výsledkem odlišného stupně diferenciace. Identifikace molekul zapojených do procesů diferenciace a dediferenciace v nádorech může pomoci odhalit mechanizmus regulace karcinogeneze, a tím přispět k nalezení nových cílů vhodných pro terapii.

Abstract:

Cancer disease represents a major global problem. Because of ever-increasing incidence, many researchers are focused on development of diagnostic, prognostic and predictive factors to improve diagnosis and therapy. This thesis is focused on breast cancer study, most frequently diagnosed type of cancer in women. Specifically, it is focused on "triple-negative" breast cancer (TNBC) which is characterised by low expression of estrogen and progesterone receptors and human epidermal growth factor receptor 2. Insufficient amount of biological markers is the main limitation of TNBC diagnosis. The aim of this thesis is detection of selected miRNAs that differ in gene expression profile in various morphological entities present in the tumor. Tumor heterogeneity reflects both, the different behavior of individual cell types and the response to therapy. 8 miRNAs (miR-200C-3p, miR-205-5p, miR-150-5p, miR-185-5p, miR-155-5p, miR-4417, miR143-3p, miR-182-5p) were selected by microarray analysis of individual morphological structures. Their heterogeneous expression was verified by ISH and RT-qPCR methods. Aberrant expression profiles of that miRNAs are probably result from a different degree of diferentiation. Identification of molecules involved in differentiation and dediferentiation of tumors can reveal the mechanism of regulation of carcinogenesis, thereby help to find new targets for therapy.

Keywords

Karcinom prsu, TNBC, miRNA, PCR, in situ hybridizace

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 6. 5. 2019

Thesis defence

• Date of defence: 4. 6. 2019
• Supervisor: Mgr. Mária Janíková, Ph.D.

Palacký University Olomouc

Faculty of Science

Master programme / field:
Biochemistry / Biotechnology and Gene Engineering