Cirkulující mikroRNA u mnohočetného myelomu

Mgr. Veronika Kubaczková

Advanced ('rigorózní') thesis

Circulating microRNAs in multiple myeloma

Abstract:

MikroRNA (miRNA), krátké jednořetezcové nekódující molekuly RNA, se podílejí na post-transkripční regulaci genové exprese. Jejich deregulace byla zaznamenána u řady onemocnění, včetně mnohočetného myelomu (MM). V současnosti se pozornost vědců obrací na cirkulující formy těchto molekul nacházejících se v tělních tekutinách člověka. Cirkulující miRNA skýtají potenciál stát se minimálně invazivním markerem MM, neboť se jedná o snadno přístupné, kvantifikovatelné molekuly vyznačující se vysokou stabilitou. Několik studií se zabývalo využitím těchto molekul v periferní krvi pacientů s MM, avšak dosud nebyla publikována studie zabývající se stanovením miRNA v moči. Cílem práce bylo identifikovat miRNA nacházející se v moči pacientů s MM, které by mohly sloužit jako diagnostický neinvazivní marker tohoto onemocnění. Profilováním hladin exprese miRNA pomocí platformy Serum/Plasma Focus MicroRNA PCR Panel ve vzorcích moče pacientů s MM a zdravých dárců (ZD) bylo stanoveno 20 deregulovaných miRNA (p < 0,05). Z nich osm, které byly dříve popsány v souvislosti s patogenezí MM, bylo vybráno pro validaci pomocí kvantitativní real-time PCR s využitím TaqMan miRNAs assays na větším souboru pacientů s MM, ZD a dále rozšířeného o pacienty s renálním karcinomem (RCC). Pacienti s RCC byli zařazeni z důvodu odlišení specifických miRNA souvisejících s MM nikoliv pouze s poškozením ledvin. Validací nebyla potvrzena statistická významnost v hladinách exprese vybraných miRNA zjištěná na základě předchozího profilování. Pouze jediná miR-22-3p vykazovala rozdílný expresní profil v blízkosti statistické významnosti (p = 0,090) mezi pacienty s MM a ZD.

Abstract:

MicroRNAs (miRNA), short single-stranded non-coding RNA molecules are involved in post-transcriptional regulation of expression of genes. Their deregulation has been observed in pathogenesis of many diseases, including multiple myeloma (MM). Currently, attention of scientists is turning to circulating forms of these molecules located in the body fluids of humans. Circulating miRNAs have a potential to become minimally invasive marker of MM, as these molecules are readily accessible, quantifiable and stable. Several studies analyzed circulating miRNA in in peripheral blood of MM patients but no studies of these molecules in urine of MM patients have been published so far. The aim of this study was to identify miRNAs found in urine of MM patients, which could serve as diagnostic non-invasive marker of this disease. Expression profiling of levels of miRNAs using platform Serum/Plasma Focus MicroRNA Panel PCR in urine samples of MM patients and healthy donors (HD) determined 20 deregulated miRNAs (p < 0.05). Eight of them were previously described in pathogenesis of MM and were selected for validation by quantitative real-time PCR using TaqMan miRNAs assays on a larger group of patients with MM, HD and further extended to patients with renal cell carcinoma (RCC). RCC patients were added for differentiation of specific miRNAs associated in MM not only with renal insufficiency. Validation was not confirmed the statistical significance of the expression levels of selected miRNAs identified based on previous profiling. Only one miR-22-3p showed a differential expression profile close to statistical significance (p = 0.090) for MM patients and HD.

Keywords

mnohočetný myelom, cirkulující mikroRNA, neinvazivní marker z moči, expresní profilování mikroRNA, multiple myeloma, circulating microRNAs, noninvasive marker from urine, microRNA expression profiles

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 5. 10. 2016

Thesis defence

• Date of defence: 11. 1. 2017
• Reader: doc. RNDr. Ondřej Slabý, Ph.D., prof. MUDr. Vladimír Maisnar, CSc.,MBA

Masaryk University

Faculty of Science

Advanced ('rigorózní řízení') programme / field:
Experimental Biology / Molecular Biology and Genetics