Analysis of Tools and Pipeline for Processing Long-Read Sequencing Data – Barbora SOUKUPOVÁ
Barbora SOUKUPOVÁ
Bachelor's thesis
Analysis of Tools and Pipeline for Processing Long-Read Sequencing Data
Abstract:
Long-read sequencing is a technology that has revolutionised the field of genomics. Unlike previously used sequencing techniques, which are able to read only short fragments of DNA, long-read sequencing can produce reads of tens of thousands of bases in length, providing a new and more comprehensive view of the genome. This thesis introduces the principles of long-read sequencing and its advantages …moreAbstract:
Long-read sekvenování je technologie, která způsobila revoluci v oblasti genomiky. Na rozdíl od dříve používaných sekvenačních technik, které dokážou přečíst pouze krátké úseky DNA, long-read sekvenování dokáže číst až desítky tisíc bází najednou, což poskytuje nový a komplexnější pohled na genom. Tato práce představuje principy long-read sekvenování a jeho výhody a nevýhody oproti jiným metodám sekvenování …more
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 31. 5. 2023
Accessible from:: 31. 12. 2999
Thesis defence
- Supervisor: Ing. Lucie Houdová, Ph.D.
Citation record
ISO 690-compliant citation record:
SOUKUPOVÁ, Barbora. \textit{Analysis of Tools and Pipeline for Processing Long-Read Sequencing Data}. Online. Bachelor's thesis. Plzeň: University of West Bohemia, Faculty of Applied Sciences. 2023. Available from: https://theses.cz/id/kqax9u/.
The right form of listing the thesis as a source quoted
SOUKUPOVÁ, Barbora. Analysis of Tools and Pipeline for Processing Long-Read Sequencing Data. Plzeň, 2023. bakalářská práce (Bc.). ZÁPADOČESKÁ UNIVERZITA V PLZNI. Fakulta aplikovaných věd
Full text of thesis
Accessibility: Autor si nepřeje zpřístupnění práce veřejnosti
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- Soubory jsou nedostupné.
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: ZÁPADOČESKÁ UNIVERZITA V PLZNI, Fakulta aplikovaných vědVázaný výtisk práce naleznete v Univerzitní knihovně ZČU, více na http://www.knihovna.zcu.cz/kvalifikacni-prace/
University of West Bohemia
Faculty of Applied SciencesBachelor programme / field:
Cybernetics and Control Engineering / Artificial Intelligence and Automation
Theses on a related topic
-
Analýza patogenních genetických variant u dětí s mentálními retardacemi pomocí metod komparativní genomové hybridizace na mikročipech (array-CGH) a sekvenování "nové generace" (NGS)
Markéta Wayhelová -
Analýza vybraných genů pro stanovení genetických predispozic ovlivňujících sportovní výkon pomocí sekvenování nové generace
Lucie Kulišťáková -
Molekulární charakterizace rezistence a virulence epidemických klonů Klebsiella pneumoniae pomocí sekvenování nové generace
Martina Strnadová -
Isocitrát dehydrogenáza u difúzních gliomů: mutační analýza genů IDH1/2 pomocí sekvenování nové generace (NGS)
Kateřina Zettlová -
Aplikace sekvenování nové generace pro fylogenetickou analýzu bakteriálních genomů a metagenomiku
Vojtěch Kovařovic -
Sekvenování nové generace při studiu regulace genů u rostlin
David Vlk -
Detekce patogenních genetických variant pomocí sekvenování nové generace u dětských pacientů s mentální retardací
Hana Poláčková -
Prognostické markery chronické lymfocytární leukemie a význam sekvenování nové generace při jejich analýze
Barbara Vonková