Úloha genu pro TOMM40 v patogenezi mírné kognitivní poruchy

Bc. Barbora Tomečková

Bachelor's thesis

The role of the TOMM40 gene in the pathogenesis of mild cognitive impairment

Abstract:

Mírná kognitivní porucha bývá vývojovým předstupněm demencí, nejčastěji Alzheimerovy choroby. Mírná kognitivní porucha je multifaktoriální onemocnění bez objasněné patogeneze, s neurčitým průběhem a s absencí možnosti účinné léčby. Jedním z faktorů zasahujících do patogeneze mírné kognitivní poruchy je genetická složka. Tato práce je zaměřena na studium vztahu mezi polymorfismy rs157580, rs157581 a rs2075650 genu TOMM40 a mírnou kognitivní poruchou. Teoretická část je zaměřena na obecnou charakteristiku, rizikové faktory, diagnózu, prevenci a léčbu mírné kognitivní poruchy a také na charakteristiku genu TOMM40. V praktické části byl proveden výzkum pomocí asociační studie. Vzorky byly získány od osob s mírnou kognitivní poruchou a jako kontrola byly použity vzorky od osob, u nichž bylo toto onemocnění vyloučeno. Genetická analýza byla provedena u 65 kontrol a 67 pacientů. Byla porovnávána frekvence výskytu polymorfismů mezi pacienty a kontrolami. DNA byla izolována ze vzorku plné krve, následovala multiplexová PCR a metoda SnaPshot s využitím výstupu kapilární elektroforézy na automatickém genetickém analyzátoru. Získané výsledky byly vyhodnoceny statisticky. Nebyla zjištěna statisticky významná asociace mezi uvedenými polymorfizmy a patogenezí mírné kognitivní poruchy.

Abstract:

Mild Cognitive Impairment is often a development precursor of dementia, particular of the Alzheimer's disease. It is a multifactorial disease without explained origin or pathogenesis, it has an unclear development and therefor no clear therapy. The genetic component is one of the influencing factors of the pathogenesis of Mild Cognitive Impairment. This thesis focuses on the study of the association between polymorphisms rs157580, rs157581 and rs2075650 of the TOMM40 gene and the pathogenesis of the Mild Cognitive Impairment. In the theoretical part of this thesis I describe the general characteristics, risk factors, diagnosis, prevention and therapy of Mild Cognitive Impairment. In the practical part of this thesis I have done a research using the association study. Samples were taken from patients with the Mild Cognitive Impairment, samples from persons without Mild Cognitive Impairment were used as controls. Genetic analysis was done with 67 patients and 65 controls. I compared the frequency of polymorphisms amongst the patients and the controls. DNA was isolated from the samples of whole blood, followed by the multiplex PCR and the SnaPshot method, using the output of the capillary electrophoresis on the automatic genetic analyser. The results were statistically ecaluated. No statistically significant association was found between the mentioned polymorphisms and the pathogenesis of Mild Cognitive Impairment.

Keywords

Mírná kognitivní porucha, SNP, TOMM40, asociační studie, Mild cognitive impairment, TOMM40 gene, association study

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 14. 5. 2018

Thesis defence

• Date of defence: 12. 6. 2018
• Supervisor: prof. RNDr. Omar Šerý, Ph.D.
• Reader: doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Biochemistry / Biochemistry