NMR analýza strukturních vlastností lidského Tau proteinu

Bc. Viliam Volko

Bakalářská práce

NMR analysis of structural properties of human Tau protein

Abstract:

Tau protein is one of the key elements in the onset of multiple neurodegenerative diseases like Alzheimer’s disease, but the exact molecular mechanism of the beginning of neurodegeneration remains unknown. Tau protein belongs to the group of intrinsically disordered proteins, which restrains the study of its structure by conventional methods like X-ray crystallography and cryoelectronmicroscopy. A suitable method for the study of structure of Tau protein is nuclear magnetic resonance, which provides resolution on the level of individual aminoacids. The aim of this thesis is to describe the effect of physiological temperature on secondary structure propensities of the longest isoform of Tau protein 2N4R using advanced multidimensional NMR experiments implementing the method of nonuniform sampling.

Abstract:

Tau protein je jedním z klíčových elementů rozvoje několika neurodegenerativních onemocnění, jako je například Alzheimerova choroba, ale přesný molekulární mechanismus počátku neurodegenerace zůstává neznámý. Tau protein patří do skupiny přirozeně neuspořádaných proteinů, což znemožňuje studium jeho struktury pomocí běžných metod strukturní charakterizace, jako je například rentgenová krystalografie nebo kryoelektronová mikroskopie. Vhodnou metodou pro studium struktury Tau proteinu je nukleární magnetická rezonance, která poskytuje rozlišení na úrovni jednotlivých aminokyselin. Cílem práce je popsat vliv fyziologické teploty na populace sekundárních struktur nejdelší izoformy Tau proteinu 2N4R použitím pokročilých vícedimenzionálních NMR experimentů implementujících metodu neuniformního vzorkování.

Klíčová slova

tau protein, nukleární magnetická rezonance, metoda neuniformního vzorkování, populace sekundárních struktur, přirozeně neuspořádaný protein, nuclear magnetic resonance, non-uniform sampling, secondary structure propensities, intrinsically disordered protein

Jazyk práce: slovenština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 31. 5. 2023

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 29. 6. 2023
• Vedoucí: doc. RNDr. Mgr. Jozef Hritz, Ph.D.
• Oponent: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Chemie / Chemie