Rozpoznání chemicky modifikované DNA proteiny rodiny p53

Mgr. Tomáš Komárek

Bakalářská práce

Recognition of chemically modified DNA by p53-family proteins

Anotace:

V posledních 30 letech bylo učiněno mnoho důležitých objevů v boji proti rakovině. Proteiny rodiny p53 patří mezi nejvýznamnější nádorové supresorové proteiny v buňce, což dokazuje i fakt, že mutace v genu p53 se vyskytují ve více než 50% všech typů nádorů. Proteiny rodiny p53 jsou zodpovědné za kontrolu opravy poškozené DNA, zastavení buněčného cyklu anebo programovanou buněčnou smrt. Funkce těchto proteinů je proto přímo závislá na jejich schopnosti vázat se na DNA. V experimentální části této bakalářské práce jsme se zaměřili na to, jak různé poškození DNA ovlivňuje vazbu proteinu p53 a čtyř isoforem proteinu p73 na tuto DNA. V první části jsme zkoumali, jak a jestli se liší vazba čtyř různých isoforem proteinu p73 na DNA poškozenou buď cisplatinou nebo jinými platinovými komplexy ve srovnání s vazbou k proteinu p53. V druhé části jsme zkoušeli, jak ovlivňuje inkorporace modifikovaných nukleosid-trifosfátů do specifické cílové sekvence vazbu proteinů rodiny p53 na tuto DNA.

Abstract:

Over the past 30 years many important cancer-related studies were made. The p53-family proteins belong to the most important tumor suppressors, which indicate the fact that mutated forms of protein p53 were found in more than 50 % of human cancer types. The p53-family protein members are important in processes of DNA repair, cell cycle arrest or apoptosis. The biological activities of p53-family proteins are closely connected with their ability to bind DNA. In experimental part of this work we were focused on effects of DNA modification with cisplatin and other platinum complexes on p73-DNA binding in comparison with protein p53. Second part of experiments was focused on effect of incorporation of modified nucleotides into specific binding site on binding of p53-family proteins to this DNA.

Keywords

p73, p53, DNA damage, platinum drugs, modified nucleotide, DNA-protein binding

Jazyk práce: angličtina

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 14. 5. 2010

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 14. 6. 2010
• Vedoucí: Mgr. Hana Pivoňková, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Biochemie