Analýza molekulárních prognostických markerů chronické lymfocytární leukémie

Bc. Jaroslav Zelený

Diplomová práce

Analysis of molecular prognostic markers in chronic lymphocytic leukemia

Anotace:

Chronická lymfocytární leukémie (CLL) je hematoonkologické onemocnění s velmi variabilním klinickým průběhem. Na základě stanovení molekulárních markerů lze pacienty rozdělit do dvou prognosticky odlišných skupin s významně odlišnou průměrnou dobou přežití. Mezi tyto markery patří mutační stav antionkogenu p53, mutace/delece v genu ATM, přítomnost somatických hypermutací v těžkém řetězci imunoglobulinových genů (IgVH), některé chromozomové aberace a rozdílná exprese některých genů a microRNA. K analýze těchto markerů se začínají s úspěchem využívat čipové technologie detekující změny na úrovni DNA (aCGH, SNP čipy, resekvenační čipy…) i RNA (expresní čipy, miR-čipy…). Diplomová práce bude zaměřena na zavedení těchto přístupů do diagnostiky chronické lymfocytární leukémie a získání nových poznatků přispívajících k odhalení vlastností leukemických buněk.

Abstract:

Chronic lymphocytic leukemia (CLL) is haemato-oncology cancer with very variable progression. By the prognostic markers patients can be separated into two different groups with significantly different level of survival. Markers include mutation status of p53 anti-oncogene, mutation or deletion in ATM gene, presence of somatic IgVH hypermutations, certain chromosome aberations and differences in certain genes and microRNA expression. Array technologies such as aCGH, SNP arrays and resequencing arrays have become very useful tools for detection changes in DNA or RNA level. Aim of this thesis is introduction of resequencing array technology to CLL diagnostic and acquisition of new findings helping in better characterization of leukemic cells.

Klíčová slova

chronická lymfocytární leukemie, resekvenační čip, TP53, Affymetrix

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 17. 5. 2010

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 16. 6. 2010
• Vedoucí: prof. RNDr. Šárka Pospíšilová, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Molekulární biologie a genetika