Kvantitativní měření exprese aktivací indukované deaminázy a jejích sestřihových variant u pacientů s chronickou lymfocytární leukémií

Bc. Veronika Svobodová

Master's thesis

Quantitative measurement of expression of activation induced deaminase and its splice variants in patients with chronic lymphocytic leukemia

Abstract:

Aktivací indukovaná deamináza (AID) je DNA deaminační enzym, který deaminuje deoxycytidin na deoxyuracil, což vede k vytváření mutací v DNA. Tato schopnost AID je vyžadována pro dva biologicky významné procesy – somatické hypermutace a izotypový přesmyk imunoglobulinových třid. Za správných fyziologických podmínek je aktivita AID omezena do imunoglobulinového genu. Za patologických podmínek může dojít k deregulaci AID, následkem čehož jsou mutovány geny mimo imunoglobulinovy lokus. AID byla popsána v souvislosti s několika typy nádorových onemocnění včetně chronické lymfocytární leukémie (CLL). U CLL dochází až v 80% k genomovým aberacím, u některých z nich byla popsána souvislost s AID. V této diplomové práci byla detekována hladina AID u kohorty pacientů s CLL a následně byla exprese AID asociována se známými karyotypovými aberacemi CLL – delece 17p, delece 11q, komplexní karyotyp, mutační status imunoglobulinového genu.

Abstract:

Activation induced cytidine deaminase (AID) is a DNA deamination enzyme which deaminates deoxycytidine to deoxyuracil, leading to creation of mutations in the DNA. This ability of AID is required for two biologically important processes - somatic hypermutation and class switch recombination. Under correct physiological conditions, the activity of the AID is limited to immunoglobulin gene. Pathological conditions may lead to deregulation of AID, resulting mutated genes outside the immunoglobulin loci. AID has been described in connection with several types of cancers including chronic lymphocytic leukemia (CLL). In CLL, occurs in up to 80% to genomic aberrations, some of them have been described related to AID. In this thesis we have been detected levels of AID in a cohort of patients with CLL and subsequently AID expression was associated with known CLL karyotype aberrations - 17p, 11q deletion, a complex karyotype, mutational status of the immunoglobulin gene.

Keywords

aktivací indukovaná deamináza, AID, chronická lymfocytární leukémie, CLL, komplexní karyotyp, prognostické faktory CLL, sestřihové varianty AID, activation induced deaminase, chronic lymphocytic leukemia, karyotype complexity, prognostic factors of CLL, splice variants of AID

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 10. 5. 2016

Thesis defence

• Date of defence: 7. 6. 2016
• Supervisor: Mgr. Kristína Zápražná, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / field:
Experimental Biology / Molecular Biology and Genetics