Tvorba biofilmu u kmenů \kur{Arcobacter butzleri}

Bc. Irena Musilová

Diplomová práce

Biofilm Formation in \kur{Arcobacter butzleri} strains

Anotace:

Diplomová práce pojednává o schopnosti tvorby biofilmu u vybraných kmenů Arcobacter butzleri. Teoretická část práce je zaměřena na obecnou charakteristiku rodu Arcobacter a mikrobiálních biofilmů, popsány jsou také metody využívané pro jejich detekci. Experimentální část se zabývá hodnocením předpokladů pro tvorbu biofilmů na základě výsledků testů motility a testů na agaru s kongo červení. Kvantitativně byla tvorba biofilmu hodnocena s využitím Christensenovy metody v mikrotitračních destičkách, a to za statických a dynamických podmínek kultivace. Cílem práce bylo také optimalizovat protokol PCR pro detekci genů souvisejících s tvorbou biofilmu arkobakterů a vyhodnotit vliv přítomnosti těchto genů na intenzitu tvorby biofilmu.

Abstract:

The diploma thesis deals with the biofilm formation ability of selected Arcobacter butzleri strains. The theoretical part is focused on the general characteristics of the genus Arcobacter and microbial biofilms, methods used for their detection are also described. The experimental part deals with the evaluation of the preconditions for biofilm formation based on the results of motility assays and congo red agar assays. Biofilm formation was quantitatively assessed using the Christensen method in microtiter plates under static and dynamic cultivation conditions. The aim of this thesis was also to optimize the PCR protocol for biofilm-associated genes detection and to evaluate the effect of these genes on biofilm formation.

Klíčová slova

Arcobacter butzleri, biofilm, testování motility, agar s kongo červení, Christensenova metoda, statické metody, dynamické metody, polymerázová řetězová reakce, PCR, geny tvorby biofilmu

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 3. 5. 2024

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 4. 6. 2024
• Vedoucí: doc. Ing. David Šilha, Ph.D.

Univerzita Pardubice

Fakulta chemicko-technologická

Magisterský studijní program / obor:
Bioanalytická laboratorní diagnostika ve zdravotnictví / Bioanalytická laboratorní diagnostika ve zdravotnictví