Vícerozměrné modelování přežití a úspěšnosti léčby u pacientů s chronickou lymfocytární leukémií

Bc. Barbora Lakotová

Master's thesis

Multivariate modelling of survival and treatment efficacy in patients with chronic lymphocytic leukaemia

Abstract:

This thesis deals with the analysis of survival and treatment efficacy in patients with chronic lymphocytic leukaemia. In medicine, survival analysis and evaluation of treatment efficacy can be used for better disease understanding, which leads to an improvement of the treatment methods. The thesis presents a summary of the known facts about this disease and also an overview of statistical methods used in analyses, such as overall survival, progression-free survival and competing risks analysis. In the practical part, the theoretical knowledge was applied to data from the hemato-oncological registry CLLEAR. The aim of the work was to analyze survival of patients based on selected prognostic factors and also to evaluate the effect of the first treatment regimen. The analysis was done by univariate analysis followed by multivariate modelling. The thesis also dealt with various methods of selecting a final model, such as selection and group LASSO. The results showed, that overall survival was influenced by the age of patients, the molecular-genetic status and the initial treatment regimen. Progression-free survival was affected also by the immunoglobulin heavy chain gene mutation status. Best treatment regimens contained rituximab and fludarabin. Patients, treated with those regimens, showed better treatment response rate and also had lower risk of disease progression or death.

Abstract:

Tato diplomová práce se zabývá analýzou přežití pacientů s chronickou lymfocytární leukémií a vyhodnocením úspěšnosti jejich léčby. Analýzu přežití a hodnocení léčby je v medicíně možné použít na lepší porozumění samotného onemocnění, a tím rovněž ke zefektivnění léčebných metod. Předložená diplomová práce obsahuje shrnutí známých faktů o této nemoci a taky přehled statistických metod potřebných k analýze, mezi které patří celkové přežití, přežití bez progrese a analýza kompetitivních rizik. V praktické části byly teoretické poznatky aplikovány na data z hemato-onkologického registru CLLEAR. Cílem práce bylo analyzovat přežití pacientů na základě vybraných prognostických faktorů a rovněž vyhodnotit úspěšnost prvního léčebného režimu. Analýza byla zpracovaná nejprve pomocí jednorozměrné analýzy a následně vícerozměrného modelování. Práce se zabývá také způsobem výběru finálního modelu pomocí selekce a skupinového LASSO. Plyne z ní, že na celkové přežití pacientů má výrazný vliv věk, molekulárně-genetický status pacienta a výběr prvního léčebného režimu. Přežití bez progrese je navíc ovlivněno také přítomností mutace těžkého imunoglobulínu. Nejlepší léčebné režimy byly takové, které obsahovaly složku rituximab a fludarabín. Takto léčení pacienti zaznamenali lepší odpověď na léčbu a nižší riziko progrese onemocnění nebo úmrtí.

Keywords

chronická lymfocytární leukémie, vícerozměrné modelovaní, analýza přežití, úspěšnost léčby, skupinové LASSO, chronic lymphocytic leukaemia, multivariate modelling, survival analysis, treatment efficacy, group LASSO

Language used: Slovak

Date on which the thesis was submitted / produced: 15. 6. 2020

Thesis defence

• Date of defence: 30. 6. 2020
• Supervisor: RNDr. Eva Koriťáková, Ph.D.
• Reader: Mgr. Ondřej Pokora, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / field:
Experimental Biology / Mathematical Biology