Celogenomový CRISPR/Cas9 screening pro určení genů schopných obnovení exprese CD20 a zlepšení účinnosti CD20 monoklonálních protilátek

Bc. Lenka Dostálová

Diplomová práce

Genome-wide CRISPR/Cas9 screening to reveal genes able to upregulate CD20 and thereby enhance the efficacy of CD20 monoclonal antibodies

Anotace:

Chemoimunoterapie, která zahrnuje podávání anti-CD20 monoklonálních protilátek, je standardní léčbou chronické lymfatické leukémie a non-hodgkinovských lymfomů. Maligní B-lymfocyty bohužel často snižují expresi molekuly CD20 na svém povrchu, což vede ke vzniku rezistence a následnému selhání terapie. Cílem této diplomové práce bylo provést celogenomový CRISPR/Cas9 screening pro určení genů, které jsou schopné navýšit expresi CD20 molekuly. Vybrané geny odhalené pomocí screeningu byly dále validovány a byla navržena jejich role v regulaci CD20 molekuly. Tyto geny budou dále sloužit pro navržení nových strategií schopných zvýšit expresi CD20 proteinu a tím zlepšit terapeutickou odpověď na anti-CD20 monoklonální protilátky.

Abstract:

Chemoimmunotherapy, which includes administration of anti-CD20 monoclonal antibodies, is the first-line treatment for chronic lymphocytic leukaemia and non-Hodgkin lymphomas. Unfortunately, malignant B cells often downregulate the expression of CD20 molecule on their surface, which leads to the development of drug resistance and thus the therapy fails. This diploma thesis aimed to perform genome-wide CRISPR/Cas9 screening to reveal genes that are able to upregulate CD20 expression. Selected top screening hits were further validated and their role in CD20 regulation was suggested. These genes shall serve to propose novel strategies able to enhance CD20 protein expression and thereby to improve therapy response to the anti-CD20 monoclonal antibodies.

Keywords

CRISPR, Cas9, screening, CD20, chronická lymfocytární leukémie, lymfomy, chronic lymphocytic leukaemia, lymphomas

Jazyk práce: angličtina

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 16. 6. 2020

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 7. 7. 2020
• Vedoucí: Mgr. Michal Šmída, Dr. rer. nat.
• Oponent: Ph.D. Fedor Nikulenkov

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Bioanalytická laboratorní diagnostika ve zdravotnictví - Lékařská genetika a molekulární diagnostika / Bioanalytická laboratorní diagnostika ve zdravotnictví - Lékařská genetika a molekulární diagnostika