Bc. Anežka Tichá

Master's thesis

Vlastnosti nekanonických bázových párů v DNA a DNA/protein komplexech

Properties of Non-canonical Base Pairs in DNA and DNA/Protein Complexes
Anotácia:
Předložená práce má za cíl analyzovat strukturu a termodynamickou stabilitu nekanonických bázových párů (mismatchů) v DNA a DNA/protein komplexech. Zaměřili jsme se na bázové parametry Shear a Opening, jelikož bylo zjištěno, že jsou důležité při rozpoznávání mismatchů proteinem MutS. Analýza byla založena na 9 596 experimentálních strukturách z databáze PDB, ze kterých jsme získali 245 020 bázových …viac
Abstract:
This work aimed to analyse the structure and thermodynamic stability of non-canonical base pairs (mismatches) in DNA and DNA/protein complexes. We focused on the base-pair parameters Shear and Opening as they were found to be important in the mismatch recognition by MutS protein. The analysis was based on 9 596 experimental structures from the PDB database, from which we extracted 245 020 base pairs …viac
 
 
Jazyk práce: English
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 18. 5. 2023

Obhajoba závěrečné práce

  • Obhajoba proběhla 21. 6. 2023
  • Vedúci: RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D.
  • Oponent: Mgr. Lenka Malinovská, Ph.D.

Citační záznam

Plný text práce

Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:
  • světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta